Po se prepara para ser el líder espiritual del Valle de la Paz, buscando un sucesor como Guerrero Dragón. Mientras entrena a un nuevo practicante de kung fu, enfrenta al villano llamado "el Camaleón", que evoca villanos del pasado, desafiando todo lo que Po y sus amigos han aprendido.

Después de años de estar protegidos del mundo humano, los hermanos Turtle se propusieron ganarse los corazones de los neoyorquinos y ser aceptados como adolescentes normales a través de actos heroicos. Su nueva amiga April O'Neil los ayuda a enfrentarse a un notorio sindicato del crimen, pero pronto se vuelven locos cuando un ejército de mutantes se desata sobre ellos.

La comedia musical sigue a los cangrejos ermitaños que viven bajo el paseo marítimo de la costa de Jersey. Cuando Armen (un habitante de la ciudad cangrejo de tierra) se enamora de Ramona (una turista cangrejo de mar), aumentan las tensiones entre sus amigos y familias. Pero cuando una tormenta arroja al dúo lejos de casa, su amor les llevará a una aventura épica que unirá a la dividida comunidad.